Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ZNF548Q8NEK5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ZNF548Q8NEK5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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