Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC112Q8NEF3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms