Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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