Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF23Q7RTU1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms