Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM43BQ6ZT52 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM43BQ6ZT52 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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