Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC73Q6ZRK6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms