Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A10Q6U841 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A10Q6U841 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms