Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF880Q6PDB4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms