Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6P435 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6P435 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms