Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM236Q5W0B7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM236Q5W0B7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms