Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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