Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CC2D1BQ5T0F9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1BQ5T0F9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms