Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NHSL1Q5SYE7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms