Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C6orf10Q5SRN2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms