Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms