Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms