Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf21Q32NC0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms