Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HFEQ30201 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms