Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXD1Q16676 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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