Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GABRA6Q16445 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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