Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms