Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX1Q15475 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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