Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCF4Q15080 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCF4Q15080 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms