Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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