Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX2Q13950 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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