Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTAN1Q13813 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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