Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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