Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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