Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECH1Q13011 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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