Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSTF3Q12996 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CSTF3Q12996 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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