Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMAN2Q12907 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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