Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms