Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF4Q08170 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms