Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC3A1Q07837 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms