Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms