Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms