Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAV1Q03135 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms