Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLH2Q02577 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLH2Q02577 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms