Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OC90Q02509 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms