Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms