Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms