Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2BQ00403 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms