Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FAM3AP98173 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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