Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms