Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms