Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELLP55199 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELLP55199 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELLP55199 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms