Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRKAA2P54646 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms