Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOSBP53539 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOSBP53539 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOSBP53539 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOSBP53539 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOSBP53539 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOSBP53539 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms