Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A1P52655 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms