Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DAP3P51398 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms